办理养老金领取的时候，要经过档案的审核，工龄、工资、待遇、职务、社保受保时间等都是以个人档案的记录为依据的。如退休时需要依据档案认定个人出生时间，从而确定退休时间;需要确定个人参加工作时间，从而确定开始缴费或视同缴费的时间，以计算养老金金额等。除了养老金外，其他社会保险，如领取失业金等，也与个人档案相关。
有很多毕业生找到工作后，没有及时办理参加工作的有关手续，几年后仍是学生身份，从而影响转正定级和工龄及退休金的计算。
大学毕业后，学生档案需要经过转正定级后，才能成为干部档案，才能正常调动。而某些毕业生档案在毕业后既没有提交单位，也没有存在政府指定的人才服务中心，职称评定就会因手续不全而受到影响。这时，即使有了当公务员或进入事业单位、国企的机会，也无法办理相关手续。
考研、考公务员、出国、升学、结婚、生育等，这些事情都需要政府所属人才市场开具相关证明，缺少档案将无法办理这些证明。
毕业档案三大流向
首先必须确定在毕业时是否已签过三方协议，这是学生、学校和工作单位共同签的一个协议书，签了的话，报到证备注栏就不是空白，此时档案会在这个单位所在地的人才市场;没签的话，报到证备注栏为空，默认打回原籍。
这是通常认为最正规的档案流向，但据统计，这种情况大约只占到毕业生档案的10%左右的比例。
缺点：要求毕业时就能找到工作，时间相对紧迫